Утилизация биологических отходов является важным аспектом сохранения окружающей среды. На основании правил ветеринарии - уничтожение биологических отходов должно осуществляться путем использования печи-крематора и скотомогильника (биотермической ямы). К данным отходам относятся: трупы всех видов животных мертворожденные и абортированные плоды продукты ветеринарной конфискации материалы, получаемые в результате переработки пищевого, либо непищевого сырья животного происхождения. Сбор и транспортировка биологических отходов, трупов павших животных, согласно Ветеринарно-санитарных правил, для последующего уничтожения возлагается на их владельца. Руководитель хозяйства, то есть собственник умершего скота, обязан собрать и доставить трупы к месту, где будет произведена утилизация трупов животных. Расходы, связанные со сбором, транспортировкой, экспертизой и переработкой некачественной пищевой продукции также возлагаются на ее владельца.

Альтернативой способу захоронения останков на скотомогильниках выступает кремация, то есть сжигание биологических отходов в специализированных печах. Среди всех способов обезвреживания биоматериалов, кремация является самым безвредным. Категорически запрещается выброс биологических материалов: в водоемы и реки в мусорные контейнеры на территории лесополосы и полей. Данные правила установлены, чтобы не допустить их разложения и вспышек инфекционных заболеваний. Нарушение правил утилизации чревато последствиями не только для людей и животных, но и для почвы, на которой были оставлены биологические отходы.

Утилизацией имеют право заниматься организации, у которых есть в наличии крематоры для животных. Крематоры — это специальные печи для уничтожения биологических отходов. Кремация считается достаточно экономичным методом утилизации биологических отходов ввиду минимального расхода топлива. Такой вариант обезвреживания биоматериалов соответствует всем санитарным нормам. Процесс сжигания происходит под контролем ветеринарного сотрудника в крематориях или земляных ямах до неорганического и негорючего остатка.